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Im Bereich Hygiene und Mikrobiologie führt das Institut Untersuchungen im Bereich Reinigung, Desinfektion und Sterilisation durch. Dabei werden routinemäßig Bakterien und bakteriellen Sporen, Pilzen/Hefen, Surrogatviren/Bakteriophagen sowie Allergene und Milben eingesetzt.

Das Untersuchungsspektrum umfasst Laborprüfung von Produkten und Geräten, Vor-Ort-Begehungen von Produktionsanlagen sowie Bereitstellung von mikrobiologischem Probenmaterial für die interne Prüfung von Prozessen und Produkten.